Owszem, pracownik powinien mieć zaświadczenie lekarza ze zgodą na dłuższy dzień pracy.
Ósma godzina jest nadgodziną czyli płatna jak nadgodzina. Łączna liczba nadgodzin w roku nie może przekroczyć określonej ich sumy (czyli codziennie to raczej wątpię).
Nie bardzo rozumiem problemu z ujęciem w liście płac - dla ON z takimi zapisami pełny etat to 7 godzin. Można zastosować przelicznik na wymiar etatu, dzienny i godziny - wówczas wszystko się zsumuje. Program obowiązujący u mnie w firmie już to ujmuje.

W myśl art. 29 § 1 i 2 Kodeksu pracy, umowa o pracę powinna być zawarta w formie pisemnej i powinna określać strony umowy, rodzaj umowy (np. na okres próbny, na czas określony, na czas nieokreślony), datę jej zawarcia oraz warunki pracy i płacy, w tym w szczególności:
rodzaj pracy, miejsce wykonywania pracy, wynagrodzenie za pracę odpowiadające rodzajowi pracy, ze wskazaniem składników wynagrodzenia,
wymiar czasu pracy, termin rozpoczęcia pracy .
Jeżeli umowa o pracę nie została zawarta z zachowaniem formy pisemnej, pracodawca powinien – najpóźniej w dniu rozpoczęcia pracy przez pracownika – potwierdzić mu na piśmie ustalenia co do stron umowy, jej rodzaju oraz warunków.